Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms