Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms