Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms