Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRDP23468 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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