Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGAM1P18669 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms