Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MCRIP1C9JLW8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms