Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXQ1Q9C009 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms