Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms