Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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