Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTP4Q96DX8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTP4Q96DX8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RTP4Q96DX8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTP4Q96DX8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTP4Q96DX8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTP4Q96DX8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTP4Q96DX8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTP4Q96DX8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTP4Q96DX8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTP4Q96DX8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms