Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PFKM-202ENST00000340802 3176 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PCSK1-202ENST00000508626 2234 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms