Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms