Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms