Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms