Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SCN4B-201ENST00000324727 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MPP2-202ENST00000377184 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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