Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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