Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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