Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms