Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms