Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 BCL11A-204ENST00000359629 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLCB2Q00722 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms