Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL23P55773 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL23P55773 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL23P55773 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL23P55773 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL23P55773 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL23P55773 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL23P55773 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL23P55773 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL23P55773 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms