Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTGER3P43115 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTGER3P43115 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTGER3P43115 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTGER3P43115 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PTGER3P43115 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTGER3P43115 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTGER3P43115 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTGER3P43115 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTGER3P43115 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTGER3P43115 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTGER3P43115 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTGER3P43115 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTGER3P43115 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER3P43115 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER3P43115 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER3P43115 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER3P43115 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER3P43115 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms