Protein–RNA interactions for Protein: P31948

STIP1, Stress-induced-phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1P31948 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STIP1P31948 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STIP1P31948 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STIP1P31948 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STIP1P31948 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STIP1P31948 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STIP1P31948 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STIP1P31948 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STIP1P31948 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
STIP1P31948 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
STIP1P31948 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STIP1P31948 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STIP1P31948 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STIP1P31948 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STIP1P31948 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
STIP1P31948 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STIP1P31948 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STIP1P31948 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STIP1P31948 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STIP1P31948 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STIP1P31948 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STIP1P31948 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms