Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5DP30049 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms