Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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