Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP2BPQ9P2M1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms