Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms