Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms