Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms