Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms