Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC114Q96M63 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms