Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2Q8WZ74 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms