Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGR3Q8TD06 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms