Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPC24Q8NBT2 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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