Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27BQ5VT28 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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