Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TMEM107-208ENST00000532998 2358 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC110800.1-201ENST00000505498 441 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC005225.3-201ENST00000555972 519 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CHMP1B-201ENST00000526991 3054 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CDKL1-201ENST00000216378 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ITSN1-207ENST00000399338 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 VPS16-202ENST00000380445 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ELF5-205ENST00000532417 2330 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PAK1-202ENST00000356341 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 OR6F1-203ENST00000641444 1698 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms