Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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