Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms