Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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