Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC10A1Q14973 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms