Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTP4A2Q12974 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTP4A2Q12974 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTP4A2Q12974 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTP4A2Q12974 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTP4A2Q12974 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTP4A2Q12974 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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