Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms