Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms