Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms