Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYBBP04839 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYBBP04839 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYBBP04839 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYBBP04839 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYBBP04839 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYBBP04839 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYBBP04839 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms