Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms