Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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