Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms