Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms