Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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